吉木萨尔县针对全县现代畜牧业发展集约化、规模化、科学化程度不高等问题，坚持“猪羊为主导、牛为重点、禽为突破、特色养殖为补充”的发展思路，制定出台《吉木萨尔县扶持农村经济发展补助办法》，投入100万元设施畜牧业发展专项资金，引导农牧民走良种化繁育、专业化饲养、体系化防疫的现代畜牧业发展之路。

　　目前，已经争取标准化养殖小区扩建项目11个，建设高标准养殖小区45个。加大品种改良力度，提高良种率，先后引进良种公羊789只，改良本地羊10.3万只，建立畜牧业养殖合作社27个。同时大力推进县、乡、村三级动物防疫网络体系建设，大大提升疫病防控能力。