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一、温烫浸种法
把西瓜种子放入55℃的温水中，不断搅拌15分钟，自然冷却后浸种5小时。55℃为病菌致死温度，可有效地预防西瓜花叶、病毒病。
二、晒种
在春季，选择晴朗无风的天气，把种子摊在草席或报纸上，厚度1厘米，隔2小时翻动一次，使其受光均匀。阳光中的紫外线对种子上的病菌有一定的杀伤作用，并可促进种子后熟，增强西瓜种子的活力，提高发芽率。
三、药剂消毒法
一是新高脂膜浸种法：用新高脂膜100倍液浸种半小时，捞出即可，能驱避地下病虫，隔离病毒感染，不影响萌发吸胀功能，加强呼吸强度，提高种子发芽率。;二是多菌灵浸种浸种法：用50%可湿性多菌灵粉剂配制成500倍液，浸种 1小时后洗净，可防治炭疽病;三是漂白粉消毒法：将种子放入配好的2%—4%的漂白粉溶液中，浸泡30分钟后用清水洗净，可杀死种子表面的细菌。
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