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砧木主要有枳、酸柚和红桔等，目前枳砧应用最广泛，可嫁接柑、桔、橙、柚、金柑等。枳种的采集方法有两种：一是嫩籽采集；二是成熟种子采集。
1、嫩籽采集：一般在7月中旬收集枳果实，堆沤3～5天，然后用木锤用力均匀敲打，打破果皮，将果实放入水桶中去除果皮和果胶，取出种子，将种子及时用竹筛在清水池或水塘清洗干净，随后用0.3%高锰酸钾浸30分钟。方法如下：先将种子倒入木桶中，占70%体积，再倒入高锰酸钾水溶液，边倒边搅拌，种子浸入药液时间30分钟，然后倒掉药液，用清水漂洗干净，放置阴凉处晾干，晾干后即可播种。嫩籽不能久贮，否则发芽率极低。
2、成熟种子采集：9月下旬采集成熟枳果实，取种方法及种子消毒参照嫩籽。成熟种子取出后，如来不及播种，可贮藏一段时间，待收割完晚稻后再播种在晚稻田中。种子贮藏：按种子、沙体积比1：4混合均匀，沙宜选用粗沙，含水量5%～10%（用手一捏成团，轻放即散开），在室内阴凉处，先在底层垫粗沙5cm，然后将混合好的种子和沙放在上面，高35～50cm，上层再盖5cm厚粗沙，用麻袋或编织袋盖实，7～10天翻动一次，检查水分是否过于干燥，若过干应及时补充水分，重新堆贮。
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