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瓠瓜之所以有苦味，是由于苦味瓜中含有苦瓠子甙。苦味瓠瓜不能食用，食用了毒素含量多的瓠瓜会导致中毒。出现苦味瓜的主要原因是种子遗传原因，也就是种子携带有苦味基因，使得植株所结的瓜为苦味瓜。菜农在留种时，若留种株雌花接受了携带苦味基因的花粉，来年种子播种育苗长成的植株所结的瓜仍是苦味瓜。因此，农民在留种时，若发现苦味瓜，应及早拔除该植株，杜绝花粉的传播，把好种子质量关。
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