土壤是苹果生长的基础，不加管理的果园土壤紧实、通气不良、微生物活动能力低，土壤肥力差。据试验，土壤中氧的含量不低于10％，根才能正常生长。土壤中有害盐类的含量，也直接限制着苹果根系的生长，如碳酸钠、硫酸钠、氧化钠等。加强果园土壤管理，主要应从以下三个方面着手：
    一、果园清耕果园清耕是指在果园内不间作，而实行清耕的方法。清耕主要是行间耕翻和株间中耕除草，行间耕翻以秋耕较好。春耕不利保墒、果树伤根也不易恢复，但沙荒地秋耕不利固沙保墒，春耕较好。早春可在行间“顶凌耙耱”，以利保墒和提高土壤温度。一般在春天浇水后或雨后，应及时在株间中耕除草，防旱保墒，特别是盐碱地，雨后或浇水后及时中耕防止土壤板结与返盐。沙地果园春季风多干旱，应少中耕，以免土壤流失，株间中耕，雨季宜浅，一般以除掉杂草为原则。但如果降水量大，土壤水分饱和，则应以深中耕晾晒土壤，以免根系因缺氧而造成烂根。
    二、果园生草果园生草能有效的增加土壤腐殖质，改善土壤理化性质和土壤团粒结构，减小土壤温度变幅，利于苹果根系的生长发育。在土壤粘重、沙荒、盐碱果园，实行生草优点更为显著。果园生草草种可用紫花苜蓿、三叶草等。当春季地温升至15℃以上时，即可播种。也可在夏末秋初播种。播种后第一年，生草应施肥。当草长至30厘米以上时，即可割草并把草覆于树下，或埋于树下或进行沤肥。每年割草3－4次。据报道，实施生草的果园内，土壤里菌根多，能有效的提高磷肥的吸收，对贫磷区果园更为重要。
    三、果园间作在果园栽植3－4年前，因树龄小，地面覆盖率低，为充分经济的利用土地，合理的利用光能和空间，可在栽植的行间间作矮型作物。如花生、薯类等。但不可间作与树体生长有矛盾的高秆作物，也不可在行间培植吸取肥力强的林果苗木。更不能在秋季间作需肥水多的叶菜类蔬菜；如大白菜等。间作物的种类主要考虑以下几点：第一，间作物必须植株矮小，不影响树体的通风透光和正常的生长。第二，间作物要便于管理，病虫少，不传播病虫害。第三，间作物生育期要短，需肥水少，有利于提高土壤肥力和理化性质的改善。良好的间作，既能提高土地的利用率，提高经济效益，又能保证土壤肥力，防止土壤流失、返盐、返碱，能封滩固沙。应当指出的是，最近几年我国大部分果区推行果园覆草，以提高土壤肥力，改善土壤性质。具体做法是在5－6月间，用麦秸、山草等覆盖树下，厚度约15－20厘米。在上面稍加土压实。这样连续覆草2－3年，土壤中有机质含量可明显提高。既提高了土壤肥力，保土蓄水减少地面径流与蒸发，又改善土壤性质，缩小温度变幅和灭草免耕，应大力推广。