鸡冠花花大，花期长，但在南方和北方等省市均易发生褐斑病。此病由真菌引起，大部分下层叶片发病形成褐斑，在夏秋期间，病斑相连使大半个叶片或整个叶片干枯下垂，严重影响观赏和生长。症状：褐斑病，又称呈斑病，该病是鸡冠花主要病害之一，全国南北各地常有发生。发病初期，主要侵染叶片、茎及叶柄等。叶片出现黄或浅红褐色小斑，扩展成圆形、不规则病斑，边缘紫褐色，中间色较浅的病斑。老病斑中央组织变为灰褐色，轮纹明显。后期，病斑背面着生有粉红色的霉层。病斑连片可使叶片枯黄、早落，单个病斑干枯脱落则形成穿孔，近地面的茎部发病，病斑呈长条状、褐色；根茎处易发病，病斑褐色，长条形，植株易倒伏。病原及发病特点：该病菌属半知菌亚门，硫色镰孢菌和鸡冠花砖红镰孢菌。病菌以菌丝体在植株残体及落叶上过冬，翌年4至5月间产生大量分生孢子，借工具、风、雨水、浇水的飞溅传播，从伤口侵入。分生孢子萌发适温为15至20℃，水滴中萌发率最高。 
　　一般在南方(广州地区)6月上旬开始发病，7至8月发病最为严重，10月底基本结束。高温潮湿有助于其发生与蔓延，土壤透水性差，排水不良，植株长势衰弱，也容易发病。由于病菌在病残体及土壤中越冬，厚垣孢子可存活多年，分生孢子由水流传播，种子可能带菌及侵染植株。北方地区(北京地区)8月初发病，8至9月为发病盛期。台风期暴雨多，发病重，蔓延传播快。病残体多，连作，土壤湿度大等皆可加重病害的发生。防治方法：对于褐斑病，应防重于治，合理栽培。及时摘除病叶集中深埋或烧毁。盆土宜用肥沃沙质壤土，腐熟厩肥、农家肥各半，再掺入少量煤炭渣及河沙拌匀而成。
　　l.种子和土壤消毒处理：种前，种子要用50%多菌灵500倍液浸泡4小时进行消毒。土壤消毒，常用药为90%敌克松2至3克/平方米，或50%多菌灵可湿性粉剂4克/平方米或0.2至0.5%高锰酸钾或0.1%托布津溶液等处理；盆栽用土也可用太阳能热处理消毒(即将盆土倒在水泥地面或晒谷场1至2天)。
　　2．实行轮作及排除积水：发病重的地块实行轮作，间隔期2至3年。高温高湿环境下易发病于6至10月，要经常松土，防止根周围土壤板结，雨季则要及时排除积水。浇水时防止水管高抬面飞溅，并注意摆放或种植不能过密。
　　3．药剂防治：6至7月发病初期喷1：1：100波尔多液，或70%百菌清可湿性粉剂600倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液灌根处理，每盆用药量100至150克，每7至10天喷、灌一次，连续2至3次，防治效果达95%以上。50%克菌丹可湿性粉剂500倍液或25%粉锈宁可湿粉剂2000倍液，隔20至25天喷1次，连续喷2至3次，效果较好。也可用70%甲基托布津800倍至1000倍液进行叶面喷雾，对病害的发展也有良好控制作用。可用50%扑海因可湿性粉剂，对真菌类具有较好的杀灭效果，也可用25%丙环唑乳油29毫升加水100升喷雾，间隔期40至48天一次，防治效果较良好。