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小麦纹枯病在整个生育期均可发生危害，主要表现为烂芽、死苗、烂茎、枯孕穗、枯白穗和倒伏等症状。该病菌主要危害小麦茎基部1~2茎节的叶鞘和茎杆，小麦发芽后，芽鞘受侵染后变褐，随后烂芽枯死。田间病苗多在3~4片时显现症状，叶鞘病斑边缘褐色，中部灰色，呈梭形或椭圆形，病株叶色变黄，无新叶抽出而死亡。拔节后症状最为典型，侵染叶鞘后，产生云纹状病斑，逐渐扩大并向基部延伸，基部病斑成梭形，边缘褐色，中部灰白色至草黄色，节间受害，茎壁失水变软，造成倒伏。
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