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诱导变异的主要方法有以下几种：
（1）化学诱变剂。已知具有诱变功能的化学物质种类很多，如甲基碘酸乙脂（EM幻可能是用于高等植物最有效的化学诱变剂之一，这种诱变可以得到高的突变率而对染色体的危害较少。另一种很有名的化学诱变剂是秋水仙素，它的作用是作为纺素体形成的抑制剂，从而使染色体加倍形成多倍体。
（2）物理透变。能够提高突变频率的物理因素是热、紫外光和电离辐射。常用的辐射源为X一射线、a射线和快中子。一般说来，射线的穿透能力愈强，它对突变的诱导能力愈大。
（3）嵌合体的分离。在分化组织中细胞的染色体组分在某种程度上可能是不同的，例如从二倍体兰花的组织中可能分离出四倍体细胞，并且这种细胞能够分化为四倍体植株。无性系中的每一个细胞都可能具有不同的染色体数目，在离体情况下可能自发地产生染色体突变或基因突变，每一个受到影响的细胞可以分裂并形成嵌合体。利用和诱导兰花组织培养和无性繁殖中的变异，毫无疑问在将来兰花的品种改良中是非常有用的，而且随着原生质体培养，体细胞杂交，外源基因导入等细胞工程和基因工程新技术的应用，对于兰花品种的改良和优秀新品种的选育将产生巨大的影响。
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