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日光温室的高湿条件是黄瓜多种病害发生和蔓延的主要因素，但不同的温度条件与高湿结合时，会使黄瓜发生的主导病害不一样：(1)低温阶段(12月中旬到翌年2月上旬)发生的主导病害是细菌性病害，包括细菌性角斑病、细菌性斑点病、细菌性缘枯病等。(2)中温阶段(10月中旬到12月中旬，翌年的2月到4月上旬)普遍发生的主导病害是黄瓜的霜霉病，在个别温室还会暴发黄瓜蔓枯病，在满地覆盖地膜的温室还会暴发黄瓜白粉病。(3)高温阶段的主导病害是炭疽病。
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