苗期管理的总的要求是：先抓好全苗，在此基础上培育壮苗，促苗早发。各项管理的作用，主要是克服不良自然因素的影响，改善生育环境，保证幼苗正常生长。１．查苗补苗：播后及时检查，发现漏播，或有烂籽、烂芽的，要及时进行补种。棉花出苗以后要及时破膜放苗，以防高温烫苗。发现缺苗断垄的，要进行移栽补苗，如有备用苗，取备用苗移栽，没有备用苗，要采取“疏密补稀”的方法。应注意的是，不论种还是补苗，都要补保铃棉的种子或移栽保铃棉的棉苗，以保证群体的抗虫性。２．间苗定苗：保铃棉种子是脱绒包衣种子，精量播种，每穴不少于３粒。由于播种量小，出苗后拥挤程度轻，故可采取一次间苗，一次定苗的方法。间苗在１～２片真叶时进行，留壮苗，拔弱苗、病苗，做到叶不搭叶。定苗在三叶期，留苗原则与间苗相同，如遇缺苗在邻近处留双苗。３．中耕：苗期中耕是促进根系深扎，地上部健壮生长，实现壮苗早发的关键措施。中耕次数与深度应灵活掌握。天旱苗小浅中耕，雨后土湿苗旺深中耕，土壤板结要及时中耕。保铃棉多为地膜棉，部分棉农认为地膜棉中耕没有必要，这里特提醒广大棉农，地膜棉在地膜两侧中耕很有必要，可以增温保墒，为棉苗生长创造良好的环境。４．施肥：保铃棉苗期生长较慢，植株营养较小，吸收、消耗均较少，追肥应根据苗情早施、轻施或不施。基肥充足，可不追苗肥。一般大田，地力较差，基肥又少，适当追肥，为蕾期打下一定营养体的基础，搭起丰产架子。苗肥结合定苗、中耕进行，每亩施尿素不超过５公斤，对瘦弱的二、三类苗可偏施追肥，促使小苗赶大苗。５．浇水：播前浇足了底墒水的苗期不浇水，做好中耕保墒工作，实在需要浇水的，则应小水轻浇，隔沟浇，浇水后要中耕保墒，改善通气状况，提高地温。苗期土壤田间持水量以５５％～７０％为宜。６．防治病虫害：苗期病害主要有炭疽病、立枯病等；虫害有棉蚜、地老虎、蝼蛄、蓟马、红蜘蛛等。保铃棉种子经过脱绒包衣，棉苗具有一定的防病、防虫效果，但棉农也应密切注意病害、虫害。棉花播种后或是１～２片真叶期遇阴雨低温天气，土壤阴湿，棉病易发生，故棉苗出土后，要早中耕，勤中耕，深中耕，雨后要及时中耕，提高地温降低土湿，疏松土壤，促进根系发育，并结合间苗、定苗拔除病苗，并带出田外。地下害虫，采用毒饵诱杀效果好。对棉蚜、红蜘蛛等也要及时防治。棉蚜用吡虫啉效果好，红蜘蛛用齐螨素、全螨净等。