（一）焦虫病的诊断根据流行病学特点、症状、剖检变化及实验室检查结果进行综合诊断。
　　1.流行病学特点。该病靠蜱通过吸食牛羊的血液来进行传播，具有明显的季节性，7-8月为发病高峰期。巴贝斯焦虫病多发生于野外放牧牛群；泰勒焦虫病多发生于舍饲牛。
　　2.临床症状。
　　巴贝斯焦虫病：体表检查可发现多量蜱寄生。病初表现高热稽留，体温可升到40～42℃。心跳、呼吸加快，食欲减退或废绝，奶牛产奶减少。病牛迅速消瘦，出现明显的贫血和黄染。多数病牛出现啃土、血红蛋白尿。诊疗不及时，可在1周左右死亡。
　　泰勒焦虫病：体表检查可发现多量蜱寄生，高热稽留，体温可达40～42℃。随后出现体表淋巴结肿大，心跳呼吸加快，食欲减退。可视黏膜、肛门周围、乳房、阴囊等皮肤较薄处出现出血点或溢血斑。颌下、胸前发生水肿，迅速消瘦、贫血，可视黏膜轻微黄染。患牛磨牙、流涎，卧地不起，有的啃土，诊疗不及时，可在1～2周死亡，急性病例1～2天死亡。
　　3.病理变化。
　　巴贝斯焦虫病：血液稀薄如水，内脏器官被膜均有不同程度的黄染，真胃和小肠黏膜有大小不等的出血点；肝肿大，呈土黄色，胆囊肿大，胆汁变稠；肺水肿，心肌松软，心内外膜有出血点。
　　泰勒焦虫病：全身淋巴结肿大、化脓、出血、坏死，尤其下颌、肩前和腹主淋巴结，有小的结节；真胃黏膜肿胀，有小结节，多数真胃黏膜出现大小不等的溃疡灶，真胃黏膜易脱落；脾肿大、变软，被膜上有出血点。
　　4.实验室检查。
　　巴贝斯焦虫病：在体温升高后1～2天(虫体染色率高)，采取耳静脉血涂片，用瑞氏或姬氏染色法染色后，在油镜下检查，发现红细胞内虫体后确诊。虫体呈梨形、卵圆形等，虫体长度多大于红细胞半径。
　　泰勒焦虫病：在体表淋巴结肿大时期(前期)，进行肩前淋巴结穿刺液涂片染色后镜检，发现“石榴体”(淋巴细胞内的大量裂殖子)后确诊。发病中后期，采耳静脉血涂片染色镜检，发现红细胞内的虫体确诊，虫体多呈点状、环状、梨形、杆形等形态，虫体长度多小于红细胞半径。
　　（二）治疗巴贝斯焦虫病和泰勒焦虫病的防治方法基本相同。
　　1.西医治疗。应采取以杀虫为主，同时配合辅助对症治疗的方法。切忌不要单一使用杀虫药，而忽略对症疗法。对症辅助治疗包括强心、补液、健胃、消炎等。加强饲养管理，供优质饲草、精料，体质虚弱者饮奶粉，以增强抵抗力，避免高温放牧，风吹雨淋，减少应激反应。常用杀虫药物：
　　三氮脒（又称贝尼尔、血虫清），剂量为7～10毫克/千克体重，配成1%～5%溶液深部肌肉分点注射，每天或隔天1次，共用2～3次。配合天王长安(长效土霉素，0.2毫升/千克体重)和板蓝根注射液同时注射。
　　青蒿素系列制剂按2～4毫克/千克剂量口服或肌肉注射，配合应用消炎药（青、链霉素）和清热解毒药（氨基比林、柴胡等）。
　　2.中药治疗。
　　党参15克、白术10克、云苓10克、炙甘草10克、熟地10克、白芍10克、当归10克、川芎10克、柴胡15克、青蒿15克、枳壳15克、麦芽15克、神曲20克，水煎，候温灌服。
　　（三）预防
　　1.灭蜱。可采取人工捉蜱或体表喷洒药物的方法（用2.5%敌杀死油乳剂按1∶200～250倍稀释，每隔15天喷雾牛体1次，或1.5%～2%敌百虫溶液，每7天喷雾1次，还有如残杀威、溴氰菊酯、氯氰菊酯、驱蜱灵等按说明书剂量使用），对圈舍内墙面、缝隙应定期喷洒药物灭蜱，用药时谨防人畜中毒；另外，结合人工种草，深翻土地，改良土壤等措施，破坏蜱的生存条件；配合注射大环内酯类抗生素如伊维菌素、阿维菌素、多拉菌素等来控制或消灭蜱。
　　2.药物预防。在发病季节前用三氮脒、青蒿素按治疗量的一半进行预防焦虫病，一般一次用药可预防2个月左右；在老疫区一般应进行2～3次预防。
　　3.疫苗预防。泰勒焦虫病已有国产疫苗，在发病季节前用环形泰勒焦虫裂殖体胶冻细胞苗进行预防接种，20天左右产生免疫力，免疫时间为1年。巴贝斯焦虫国内目前尚无疫苗。