危害天目琼花的害虫有水木坚蚧、柳雪盾蚧和蛴螬。如有水木坚蚧危害，可在若虫盛期喷洒95%蚧螨灵乳剂400倍液或20%速克灭乳油1000倍液进行杀灭。如果有柳雪盾蚧发生，可在若虫孵化期喷洒95%蚧螨灵乳剂400倍液或10%吡虫啉可湿性粉剂2000倍液进行杀灭。如有蛴螬危害，可用50%辛硫磷乳油每亩200至250克，加水10倍喷于25千克至30千克细土上拌匀制成毒土，顺垄条施，随即浅锄，或将该毒土撤于种沟或地面，随即耕翻或混入厩肥中施用；用2%甲基异柳磷粉每亩2千克至3千克拌细土25千克至30千克制成毒土；用3%甲基异柳磷颗粒剂、3%吠哺丹颗粒剂、5%辛硫磷颗粒剂或5%地亚农颗粒剂，每亩2.5千克至3千克处理土壤。

　　天目琼花的常见病害有煤污病和猝倒病。煤污病多发生于夏季高温高湿期，如果有发生，首先应加强修剪，使植株保持通风透光，同时加强水肥管理，提高植株的抗病能力。然后应及时将刺吸类害虫杀除，防止病害蔓延。还可同时用75%百菌清可湿性颗粒800倍液进行喷雾，每周一次，连续喷洒3至4次可有效控制住病情。猝倒病易在幼苗期发生，繁殖前应对土壤进行彻底消毒，如有发生，可用福美双50%可湿性粉剂500倍液进行喷雾，每周一次，直至病情痊愈可停止喷洒。也可用粉剂直接施用于根际部，用量为每平方米2克，然后用小锄进行浅翻，每周撒施一次，直至病情痊愈。