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蛋鸡的选配方法有两种：
1．同质选配。其实质是具有同样优点的种用价值高的公鸡与母鸡定向交配。同质选配是以亲缘交配或“相似与相似”交配为基础的。表型相似的个体交配未必就能把同一性状巩固下来，特别是遗传力低的性状。只有表型和基因型相似的公鸡与母鸡选配，才能较可靠地把被选育性状固定下来。
长期同质选配可能出现近交。用基因型相似的不同家系的个体交配可以避免近交的不良影响，并使后代的被选育性状固定在应有的水平上。
2．异质选配。为了保持品系高产和品系杂交时获得的杂种优势，必须进行异质选配。性状彼此间有明显差别的公鸡与母鸡选配．叫做异质选配。这样选配既可用于品系间杂交。也可用于品系内交配。后一种方式是选不同家系的公鸡与母鸡。异质选配既可以表型选择，也可以基因型选择为基础。基因型不同家系的个体选配保证品系或配套杂交组合中出现杂种优势。从而有利于把鸡的生产性能保持在较高的水平上。目前国内外的高产配套系均采用异质选配法，中型褐壳蛋鸡就更为明显。
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